小木偶有了各种表情后，就马上去找小红狐要回红背包。拿到红背包后他十分高兴，第一时间就去蓝鼻子小女巫的家，向小女巫道谢。可是，小女巫家里没人，小木偶只好垂头丧气地离开了。老木匠见儿子这个样子就问：“你怎么了？”“我要找蓝鼻子小女巫！”小木偶回答。老木匠就说：“蓝鼻子小女巫被邪恶的黑鼻子女巫囚禁在了禁闭之塔！”小木偶听了万分着急，决定马上去寻找小女巫！

在路上，小木偶见到一只可怜巴巴的小鳄鱼，它在戏水的时候，被石头碰伤小腿了。小木偶为小鳄鱼包扎了一下，接着他们聊起天来。小鳄鱼听了小木偶的故事后，十分感动，也要和小木偶一起去救蓝鼻子小女巫。

第二天，它们以最快的速度爬过了无数座山，越过无数条小河，终于到了世界的尽头——“禁闭之塔”。坏女巫就在门口等着小木偶。小木偶走近女巫发现地上插着一把为小木偶准备的剑。“让蓝鼻子小女巫重新自由！”小木偶对着坏女王大声喊。坏女巫打了打响指，就出来一条恶龙，“让我和我的龙跟你和你的鳄鱼战斗吧！”战斗开始了，小木偶原先是打不过女巫的，可是他见到鳄鱼伤痕累累还在一次次进攻，顿时，小木偶精神百倍，越战越勇。

最后，小木偶救出了蓝鼻子小女巫，他们一起回到爸爸身边。小木偶一进门就觉得身体软软的，原来，小木偶成了一个小男孩……